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菌肥是一种活性菌，施用时必须埋于土壤中，不能撒施于地表，一般深施7～10cm。由于生物菌对作物的根系和种子不造成任何伤害，所以菌肥施用时应限度地靠近作物根系，让其与作物根系限度地接触，才能充分发挥生物菌肥的肥效。作种肥时，施于种子正下方2～3cm处；作追肥时尽量靠近根系为好；叶面喷施时，应在下午3时后进行，并喷施于叶的背面，防止紫外线。菌肥与其它肥料配合施用效果好。菌肥是一种高含菌量的生物制剂，施于土壤后需要15～20天才能发挥肥效，多数生物菌需在氮元素的作用下才能复苏，所以在施菌肥时要适量地配合少量的氮肥，一般每公顷施复合菌肥25～30kg，且根据不同情况，配合施用45～75kg尿素、75kg磷酸二铵。如与有机肥料配合施用（每公顷配施商品有机肥80kg），可加快改善土壤的理化性状，增加土壤有机质的含量，提高生物菌的活性。

、养分，肥效持久有机肥中不仅有植物必需的大量营养元素、微量元素，还含有丰富有机养分，如胡敏酸、***、生长素、和有机氮、磷的小分子化合物等。所以说有机肥是的肥料。另外，有机肥施用量允许变化幅度较大，一般不会危害作物生长。施用有机肥不仅当季作物增产，一般若于年后仍可，肥效缓慢而持久。由于腐殖质是疏松多孔的，其内聚力和内聚力比粘土小，比沙子大，因此不仅可以改善粘性土的孔隙率和通风性，而且可以改变沙子的疏松状态。腐殖质的颜色较深，可以提高土壤的吸热能力，改善土壤的热状况。腐殖质疏松，多孔，吸水蓄水能力强，可以提高土壤的持水能力。

每一种有益***都是肥料的来源，生长繁殖的无数有益***相当于肥料生产厂家移至地面，不断地向植物吸收和利用氮、磷、钾和微量元素，提高作物的产量和质量，改善土壤，深化耕作层，减少害虫的发配合足够的农家肥料，完全可以代替化肥，如果农家肥料不足，育苗用肥量可以减少百分之三十，生物有机肥料用量可以满足要求，育苗后不再使用。

事实上，防治土壤重茬需要学会使用生物菌肥，科学搭配可以更好地发挥生物菌肥对改善土壤重茬的作用，增加生态有机肥用量；由于有机质能促进土壤团粒结构，保持土壤中团粒结构不减少，提高了肥料利用率。重视微生物菌肥的应用。经过处理后的土壤应及时补充有益微生物，翻耕时，每亩施用生物菌肥，改善土壤微生物环境；翻耕时，可穴施，养护根系，提高抗性。